Проценты на положительный остаток счета могут использоваться десятником в личных целях? если использовались, то как отражать в проверке

Нет. Это все равно что сотрудник банка оптимизировал его затраты и всю разницу забрал себе. Все снимаемые суммы должны быть подтверждены заявками.

Да и % на остаток счета не являлся целью заработка десятника, если он настоящий руководитель то отнесет их на погашение задолженности участникам.